[저자] Alex Ranieri Jerônimo Lima, Gabriela Ribeiro, Vincent Louis Viala, Loyze Paola Oliveira de Lima, Antonio Jorge Martins, Claudia Renata Dos Santos Barros, Elaine Cristina Marqueze, Jardelina de Souza Todao Bernardino, Debora Botequio Moretti, Evandra Strazza Rodrigues, Elaine Vieira Santos, Ricardo Augusto Brassaloti, Raquel de Lello Rocha Campos Cassano, Pilar Drummond Sampaio Corrêa Mariani, Luan Gaspar Clemente, Patricia Akemi Assato, Felipe Allan da Silva da Costa, Mirele Daiana Poleti, Jessika Cristina Chagas Lesbon, Elisangela Chicaroni Mattos, Cecilia Artico Banho, Lívia Sacchetto, Marília Mazzi Moraes, Melissa Palmieri, Maiara Martininghi, Luiz Artur Vieira Caldeira, Fabiana Erica Vilanova da Silva, Rejane Maria Tommasini Grotto, Jayme A Souza-Neto, Marta Giovanetti, Luiz Carlos Junior Alcantara, Maurício Lacerda Nogueira, Heidge Fukumasu, Luiz Lehmann Coutinho, Simone Kashima, Raul Machado Neto, Dimas Tadeu Covas, Svetoslav Nanev Slavov, Sandra Coccuzzo Sampaio, Maria Carolina Elias
[Category] COVID19(2023년), SARS, 변종, 유전자 메커니즘,
[Article Type] Article
[Source] PMC
Abstract
Delta VOC is highly diverse with more than 120 sublineages already described as of November 30, 2021. In this study, through active monitoring of circulating severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) variants in the state of São Paulo, southeast Brazil, we identified two emerging sublineages from the ancestral AY.43 strain which were classified as AY.43.1 and AY.43.2. These sublineages were defined by the following characteristic nonsynonymous mutations ORF1ab:A4133V and ORF3a:T14I for the AY.43.1 and ORF1ab:G1155C for the AY.43.2 and our analysis reveals that they might have a likely-Brazilian origin. Much is still unknown regarding their dissemination in the state of São Paulo and Brazil as well as their potential impact on the ongoing vaccination process. However, the results obtained in this study reinforce the importance of genomic surveillance activity for timely identification of emerging SARS-CoV-2 variants which can impact the ongoing SARS-CoV-2 vaccination and public health policies.
Keywords: AY.43; Delta VOC; SARS-CoV-2; emerging sublineages; genomic surveillance.
All Keywords
【저자키워드】 SARS-CoV-2, Genomic surveillance, Delta VOC, AY.43, emerging sublineages, 【초록키워드】 Brazil, public health, vaccination, VoC, Genomic surveillance, variant, SARS-CoV-2 variant, Delta, Severe acute respiratory syndrome, Surveillance, ORF3a, dissemination, characteristic, genomic, Delta VOC, SARS-CoV-2 vaccination, Coronavirus-2, Analysis, ORF1ab, acute respiratory syndrome, acute respiratory syndrome coronavirus, acute respiratory syndrome coronavirus-2, circulating, ORF1, nonsynonymous mutation, defined, described, reveal, 【제목키워드】 genomic,
{{{ 추상적인 }}}
Delta VOC는 2021년 11월 30일 기준으로 이미 설명된 120개 이상의 하위 계통으로 매우 다양합니다. 이 연구에서 상파울루 주에서 순환하는 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스-2(SARS-CoV-2) 변종에 대한 적극적인 모니터링을 통해, 브라질 남동부에서 AY.43.1 및 AY.43.2로 분류된 조상 AY.43 계통에서 두 개의 새로운 하위 계통을 확인했습니다. 이러한 하위 계통은 AY.43.1의 경우 다음과 같은 비동의적 돌연변이 ORF1ab:A4133V 및 ORF3a:T14I 및 AY.43.2의 경우 ORF1ab:G1155C에 의해 정의되었으며 우리의 분석에 따르면 이들이 아마도 브라질 출신일 수 있습니다. 상파울루와 브라질의 보급과 진행 중인 예방 접종 과정에 대한 잠재적 영향에 대해서는 아직 많이 알려져 있지 않습니다. 그러나 이 연구에서 얻은 결과는 진행 중인 SARS-CoV-2 예방 접종 및 공중 보건 정책에 영향을 미칠 수 있는 새로운 SARS-CoV-2 변이체를 적시에 식별하기 위한 게놈 감시 활동의 중요성을 강조합니다.
{{ 키워드: }} AY.43; 델타 VOC; 사스 코로나바이러스 2; 신흥 하위 계보; 게놈 감시.