ABSTRACT Reverse transcription-PCRs (RT-PCRs) targeting SARS-CoV-2 variant of concern (VOC) mutations have been developed to simplify their tracking. We evaluated an assay targeting E484K/N501Y to identify B.1.351/P1. Whole-genome sequencing (WGS) confirmed only 72 (59.02%) of 122 consecutive RT-PCR P.1/B.1.351 candidates. Prescreening RT-PCRs must target a wider set of mutations, updated from WGS data from emerging variants.
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【저자키워드】 COVID-19, whole-genome sequencing, SARS-CoV-2, VoC, RT-PCR, reverse transcriptase PCR, WGS, 【초록키워드】 whole-genome sequencing, Mutation, B.1.351, Sequencing, mutations, SARS-CoV-2 variant, variants, N501Y, E484K, Candidates, RT-PCRs, PCRs, identify, evaluated, 【제목키워드】 P.1, concern, misidentification,
【저자키워드】 COVID-19, whole-genome sequencing, SARS-CoV-2, VoC, RT-PCR, reverse transcriptase PCR, WGS, 【초록키워드】 whole-genome sequencing, Mutation, B.1.351, Sequencing, mutations, SARS-CoV-2 variant, variants, N501Y, E484K, Candidates, RT-PCRs, PCRs, identify, evaluated, 【제목키워드】 P.1, concern, misidentification,
요약 SARS-CoV-2 관심 변종(VOC) 돌연변이를 표적으로 하는 역전사 PCR(RT-PCR)은 추적을 단순화하기 위해 개발되었습니다. 우리는 B.1.351/P1을 식별하기 위해 E484K/N501Y를 표적으로 하는 분석을 평가했습니다. 전체 게놈 시퀀싱(WGS)은 122개의 연속 RT-PCR P.1/B.1.351 후보 중 72개(59.02%)만 확인했습니다. 사전 선별 RT-PCR은 새로운 변이체의 WGS 데이터에서 업데이트된 더 넓은 돌연변이 세트를 표적으로 해야 합니다.