[저자] Pragya D. Yadav, Rima R. Sahay, Anukumar Balakrishnan, Sreelekshmy Mohandas, Chandni Radhakrishnan, Mangesh D. Gokhale, R. Balasubramanian, Priya Abraham, Nivedita Gupta, A. P. Sugunan, Rajan Khobragade, Kalpana George, Anita Shete, Savita Patil, Ullas Padinjaremattathil Thankappan, Hitesh Dighe, Jijo Koshy, Vivek Vijay, R. Gayathri, P. Jayesh Kumar, Asma Rahim, A. Naveen, Sarala Nair, V. R. Rajendran, V. Jayasree, Triparna Majumdar, Rajlaxmi Jain, Prasanth Viswanathan, Deepak Y. Patil, Abhinendra Kumar, Dimpal A. Nyayanit, Prasad Sarkale, Ashwini Waghmare, Shrikant Baradkar, Pranita Gawande, Poonam Bodke, Kaumudi Kalele, Jyoti Yemul, Sachin Dhaigude, Manjunath Holepannawar, Sanjay Gopale, Ganesh Chopade, Shilpa Ray, Priyanka Waghmare, Jitendra Narayan, Basavaraj Mathapati, Manoj Kadam, Abhimanyu Kumar, Annasaheb Suryawanshi, Beena Philomina Jose, Saritha Sivadas, N. P. Akash, T. V. Vimisha, K. V. Keerthi
We report here a Nipah virus (NiV) outbreak in Kozhikode district of Kerala state, India, which had caused fatal encephalitis in a 12-year-old boy and the outbreak response, which led to the successful containment of the disease and the related investigations. Quantitative real-time reverse transcription (RT)-PCR, ELISA-based antibody detection, and whole genome sequencing (WGS) were performed to confirm the NiV infection. Contacts of the index case were traced and isolated based on risk categorization. Bats from the areas near the epicenter of the outbreak were sampled for throat swabs, rectal swabs, and blood samples for NiV screening by real-time RT-PCR and anti-NiV bat immunoglobulin G (IgG) ELISA. A plaque reduction neutralization test was performed for the detection of neutralizing antibodies. Nipah viral RNA could be detected from blood, bronchial wash, endotracheal (ET) secretion, and cerebrospinal fluid (CSF) and anti-NiV immunoglobulin M (IgM) antibodies from the serum sample of the index case. Rapid establishment of an onsite NiV diagnostic facility and contact tracing helped in quick containment of the outbreak. NiV sequences retrieved from the clinical specimen of the index case formed a sub-cluster with the earlier reported Nipah I genotype sequences from India with more than 95% similarity. Anti-NiV IgG positivity could be detected in 21% of Pteropus medius ( P. medius ) and 37.73% of Rousettus leschenaultia ( R. leschenaultia ). Neutralizing antibodies against NiV could be detected in P. medius . Stringent surveillance and awareness campaigns need to be implemented in the area to reduce human-bat interactions and minimize spillover events, which can lead to sporadic outbreaks of NiV.
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【저자키워드】 Seropositivity, Nipah virus (NiV), Kerala, Pteropus medius, bats, 【초록키워드】 IgG, IgM, Neutralizing antibodies, antibody, Sequencing, India, Infection, diagnostic, risk, Contact tracing, ELISA, Encephalitis, serum, Immunoglobulin G, Whole genome sequencing, Viral, Antibody detection, Plaque reduction neutralization test, Immunoglobulin, Surveillance, outbreak, neutralization test, Genotype, Rapid, Cluster, Rectal swabs, bat, reverse transcription, Viral RNA, cerebrospinal fluid, Nipah virus, real-time RT-PCR, WGS, bats, Blood, CSF, Interaction, index case, similarity, immunoglobulin M, lead, Blood samples, throat swabs, epicenter, secretion, blood sample, sequence, specimen, IgG positivity, whole genome, serum sample, plaque reduction neutralization, performed, caused, reported, the disease, events, was performed, reduce, Rousettus, Pteropus, retrieved, 【제목키워드】 COVID-19, state,
우리는 인도 케랄라 주의 코지코드 지역에서 12세 소년에게 치명적인 뇌염을 일으킨 니파 바이러스(NiV) 발병과 발병 대응을 보고하여 질병의 성공적인 억제 및 관련 조사로 이어졌습니다. . NiV 감염을 확인하기 위해 정량적 실시간 역전사(RT)-PCR, ELISA 기반 항체 검출 및 전체 게놈 시퀀싱(WGS)을 수행했습니다. 지표 사례의 연락처는 위험 분류에 따라 추적 및 격리되었습니다. 발병 진원지 인근 지역의 박쥐에서 실시간 RT-PCR 및 항-NiV 박쥐 면역글로불린 G(IgG) ELISA로 NiV 스크리닝을 위해 인후 면봉, 직장 면봉 및 혈액 샘플을 채취했습니다. 중화 항체 검출을 위해 플라크 감소 중화 시험을 수행하였다. Nipah 바이러스 RNA는 혈액, 기관지 세척, 기관내(ET) 분비, 뇌척수액(CSF) 및 인덱스 케이스의 혈청 샘플에서 항-NiV 면역글로불린 M(IgM) 항체에서 검출될 수 있었습니다. 현장 NiV 진단 시설 및 접촉 추적의 신속한 구축은 발병을 신속하게 억제하는 데 도움이 되었습니다. 인덱스 케이스의 임상 표본에서 검색된 NiV 시퀀스는 이전에 보고된 인도의 Nipah I 유전자형 시퀀스와 95% 이상의 유사도로 하위 클러스터를 형성했습니다. 항-NiV IgG 양성은 Pteropus medius(P. medius)의 21%와 Rousettus leschenaultia(R. leschenaultia)의 37.73%에서 검출될 수 있었습니다. NiV에 대한 중화 항체는 P. medius에서 검출될 수 있었습니다. 인간과 박쥐의 상호 작용을 줄이고 NiV의 산발적인 발생으로 이어질 수 있는 유출 사건을 최소화하기 위해 엄격한 감시 및 인식 캠페인을 해당 지역에서 구현해야 합니다.