To date, the locus with the most robust human genetic association to COVID-19 severity is 3p21.31. Here, we integrate genome-scale CRISPR loss-of-function screens and eQTLs in diverse cell types and tissues to pinpoint genes underlying COVID-19 risk. Our findings identify SLC6A20 and CXCR6 as putative causal genes that modulate COVID-19 risk and highlight the usefulness of this integrative approach to bridge the divide between correlational and causal studies of human biology. Supplementary Information The online version contains supplementary material available at 10.1186/s13059-021-02454-4.
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【저자키워드】 COVID-19, SARS-CoV-2, eQTL, CRISPR, GWAS, 【초록키워드】 Genetic, COVID-19 severity, risk, CRISPR, eQTLs, association, genetic association, CXCR6, cell types, cell type, human biology, supplementary material, locus, tissue, tissues, loss-of-function, SLC6A20, approach, highlight, robust, identify, modulate, 【제목키워드】 approach, identify,
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현재까지 COVID-19 중증도와 가장 강력한 인간 유전적 연관성이 있는 유전자좌는 3p21.31입니다. 여기에서 우리는 다양한 세포 유형과 조직에서 게놈 규모의 CRISPR 기능 상실 화면과 eQTL을 통합하여 COVID-19 위험의 기저에 있는 유전자를 정확히 찾아냅니다. 우리의 연구 결과는 SLC6A20과 CXCR6을 COVID-19 위험을 조절하는 추정 인과 유전자로 식별하고 인간 생물학의 상관 관계 연구와 인과 관계 연구 사이의 격차를 해소하는 이 통합적 접근 방식의 유용성을 강조합니다. 보충 정보 온라인 버전에는 10.1186/s13059-021-02454-4에서 사용할 수 있는 보충 자료가 포함되어 있습니다.