[저자] Collins M Morang'a, Joyce M Ngoi, Jones Gyamfi, Dominic S Y Amuzu, Benjamin D Nuertey, Philip M Soglo, Vincent Appiah, Ivy A Asante, Paul Owusu-Oduro, Samuel Armoo, Dennis Adu-Gyasi, Nicholas Amoako, Joseph Oliver-Commey, Michael Owusu, Augustina Sylverken, Edward D Fenteng, Violette V M'cormack, Frederick Tei-Maya, Evelyn B Quansah, Reuben Ayivor-Djanie, Enock K Amoako, Isaac T Ogbe, Bright K Yemi, Israel Osei-Wusu, Deborah N A Mettle, Samirah Saiid, Kesego Tapela, Francis Dzabeng, Vanessa Magnussen, Jerry Quaye, Precious C Opurum, Rosina A Carr, Patrick T Ababio, Abdul-Karim Abass, Samuel K Akoriyea, Emmanuella Amoako, Frederick Kumi-Ansah, Oliver D Boakye, Dam K Mibut, Theophilus Odoom, Lawrence Ofori-Boadu, Emmanuel Allegye-Cudjoe, Sylvester Dassah, Victor Asoala, Kwaku P Asante, Richard O Phillips, Mike Y Osei-Atweneboana, John O Gyapong, Patrick Kuma-Aboagye, William K Ampofo, Kwabena O Duedu, Nicaise T Ndam, Yaw Bediako, Peter K Quashie, Lucas N Amenga-Etego, Gordon A Awandare
[Category] COVID19(2023년), SARS, 변종, 진단, 치료기술,
[Article Type] Article
[Source] PMC
Abstract
The COVID-19 pandemic is one of the fastest evolving pandemics in recent history. As such, the SARS-CoV-2 viral evolution needs to be continuously tracked. This study sequenced 1123 SARS-CoV-2 genomes from patient isolates (121 from arriving travellers and 1002 from communities) to track the molecular evolution and spatio-temporal dynamics of the SARS-CoV-2 variants in Ghana. The data show that initial local transmission was dominated by B.1.1 lineage, but the second wave was overwhelmingly driven by the Alpha variant. Subsequently, an unheralded variant under monitoring, B.1.1.318, dominated transmission from April to June 2021 before being displaced by Delta variants, which were introduced into community transmission in May 2021. Mutational analysis indicated that variants that took hold in Ghana harboured transmission enhancing and immune escape spike substitutions. The observed rapid viral evolution demonstrates the potential for emergence of novel variants with greater mutational fitness as observed in other parts of the world.
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{{{ 추상적인 }}}
COVID-19 대유행은 최근 역사상 가장 빠르게 진화하는 대유행 중 하나입니다. 따라서 SARS-CoV-2 바이러스 진화를 지속적으로 추적해야 합니다. 이 연구는 가나에서 SARS-CoV-2 변이체의 분자 진화와 시공간 역학을 추적하기 위해 환자 분리주(도착 여행자로부터 121개, 커뮤니티에서 1002개)에서 1123개의 SARS-CoV-2 게놈을 시퀀싱했습니다. 데이터에 따르면 초기 로컬 전송은 B.1.1 계보가 지배했지만 두 번째 물결은 알파 변종에 의해 압도적으로 주도되었습니다. 그 후, 모니터링 중인 예고되지 않은 변종 B.1.1.318이 2021년 4월부터 6월까지 전파를 지배한 후 델타 변종으로 대체되었으며 2021년 5월에 지역사회 전파에 도입되었습니다. 돌연변이 분석에 따르면 가나에서 유지되었던 변종에는 전파가 숨어 있었습니다. 강화 및 면역 탈출 스파이크 대체. 관찰된 빠른 바이러스 진화는 세계의 다른 지역에서 관찰된 것과 같이 돌연변이 적합성이 더 큰 새로운 변이체의 출현 가능성을 보여줍니다.