[저자] Mariana G López, Álvaro Chiner-Oms, Darío García de Viedma, Paula Ruiz-Rodriguez, Maria Alma Bracho, Irving Cancino-Muñoz, Giuseppe D'Auria, Griselda de Marco, Neris García-González, Galo Adrian Goig, Inmaculada Gómez-Navarro, Santiago Jiménez-Serrano, Llúcia Martinez-Priego, Paula Ruiz-Hueso, Lidia Ruiz-Roldán, Manuela Torres-Puente, Juan Alberola, Eliseo Albert, Maitane Aranzamendi Zaldumbide, María Pilar Bea-Escudero, Jose Antonio Boga, Antoni E Bordoy, Andrés Canut-Blasco, Ana Carvajal, Gustavo Cilla Eguiluz, Maria Luz Cordón Rodríguez, José J Costa-Alcalde, María de Toro, Inmaculada de Toro Peinado, Jose Luis Del Pozo, Sebastián Duchêne, Jovita Fernández-Pinero, Begoña Fuster Escrivá, Concepción Gimeno Cardona, Verónica González Galán, Nieves Gonzalo Jiménez, Silvia Hernáez Crespo, Marta Herranz, José Antonio Lepe, Carla López-Causapé, José Luis López-Hontangas, Vicente Martín, Elisa Martró, Ana Milagro Beamonte, Milagrosa Montes Ros, Rosario Moreno-Muñoz, David Navarro, José María Navarro-Marí, Anna Not, Antonio Oliver, Begoña Palop-Borrás, Mónica Parra Grande, Irene Pedrosa-Corral, Maria Carmen Pérez González, Laura Pérez-Lago, Mercedes Pérez-Ruiz, Luis Piñeiro Vázquez, Nuria Rabella, Antonio Rezusta, Lorena Robles Fonseca, Ángel Rodríguez-Villodres, Sara Sanbonmatsu-Gámez, Jon Sicilia, Alex Soriano, María Dolores Tirado Balaguer, Ignacio Torres, Alexander Tristancho, José María Marimón, SeqCOVID-Spain consortium, Mireia Coscolla, Fernando González-Candelas, Iñaki Comas
[Category] SARS, 변종, 유전자 메커니즘, 치료기술,
[Article Type] Article
[Source] PMC
Abstract
The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic has affected the world radically since 2020. Spain was one of the European countries with the highest incidence during the first wave. As a part of a consortium to monitor and study the evolution of the epidemic, we sequenced 2,170 samples, diagnosed mostly before lockdown measures. Here, we identified at least 500 introductions from multiple international sources and documented the early rise of two dominant Spanish epidemic clades (SECs), probably amplified by superspreading events. Both SECs were related closely to the initial Asian variants of SARS-CoV-2 and spread widely across Spain. We inferred a substantial reduction in the effective reproductive number of both SECs due to public-health interventions (R e < 1), also reflected in the replacement of SECs by a new variant over the summer of 2020. In summary, we reveal a notable difference in the initial genetic makeup of SARS-CoV-2 in Spain compared with other European countries and show evidence to support the effectiveness of lockdown measures in controlling virus spread, even for the most successful genetic variants.
All Keywords
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{{{ 추상적인 }}}
코로나바이러스 질병 2019(COVID-19) 대유행은 2020년부터 전 세계에 급진적인 영향을 미쳤습니다. 스페인은 첫 번째 물결에서 발병률이 가장 높은 유럽 국가 중 하나였습니다. 전염병의 진화를 모니터링하고 연구하기 위한 컨소시엄의 일환으로 우리는 대부분 봉쇄 조치 이전에 진단된 2,170개의 샘플을 시퀀싱했습니다. 여기에서 우리는 여러 국제 출처에서 최소 500건의 유입을 확인하고 두 개의 지배적인 스페인 전염병 분기군(SEC)의 초기 부상을 문서화했으며, 아마도 초확산 이벤트에 의해 증폭되었을 것입니다. 두 SEC는 SARS-CoV-2의 초기 아시아 변종과 밀접한 관련이 있으며 스페인 전역에 널리 퍼졌습니다. 우리는 공중 보건 개입(Re < 1)으로 인해 두 SEC의 유효 생식 수가 크게 감소한 것으로 추론했으며, 2020년 여름에 SEC를 새로운 변종으로 교체하는 데도 반영되었습니다. 요약하면, 우리는 주목할만한 스페인의 SARS-CoV-2 초기 유전자 구성이 다른 유럽 국가와 차이가 있으며 가장 성공적인 유전자 변이에 대해서도 바이러스 확산을 통제하는 데 있어 잠금 조치의 효과를 뒷받침하는 증거를 보여줍니다.