Objective To adapt ‘fishplots’ to describe real-time evolution of SARS-CoV-2 genomic clusters. Results This novel analysis adapted the fishplot to depict the size and duration of circulating genomic clusters over time in New South Wales, Australia. It illuminated the effectiveness of interventions on the emergence, spread and eventual elimination of clusters and distilled genomic data into clear information to inform public health action. Supplementary Information The online version contains supplementary material available at 10.1186/s13104-021-05827-x.
All Keywords
【저자키워드】 SARS-CoV-2, bioinformatics, Australia, Whole genome sequencing, Genomic epidemiology, 【초록키워드】 public health, Intervention, Spread, Effectiveness, Clusters, Evolution of SARS-CoV-2, Cluster, information, genomic, Analysis, supplementary material, genomic data, South, circulating, objective, Result, New, 【제목키워드】 COVID-19, Cluster, South, New, Documenting,
【저자키워드】 SARS-CoV-2, bioinformatics, Australia, Whole genome sequencing, Genomic epidemiology, 【초록키워드】 public health, Intervention, Spread, Effectiveness, Clusters, Evolution of SARS-CoV-2, Cluster, information, genomic, Analysis, supplementary material, genomic data, South, circulating, objective, Result, New, 【제목키워드】 COVID-19, Cluster, South, New, Documenting,
목표 SARS-CoV-2 게놈 클러스터의 실시간 진화를 설명하기 위해 'fishplot'을 적용합니다. 결과 이 새로운 분석은 호주 뉴사우스웨일즈에서 시간 경과에 따라 순환하는 게놈 클러스터의 크기와 기간을 묘사하기 위해 어시플롯을 수정했습니다. 클러스터의 출현, 확산 및 궁극적인 제거에 대한 개입의 효과를 조명하고 게놈 데이터를 명확한 정보로 정제하여 공중 보건 조치를 알렸습니다. 보충 정보 온라인 버전에는 10.1186/s13104-021-05827-x에서 사용할 수 있는 보충 자료가 포함되어 있습니다.