[저자] Lori A. Rowe, Brandon J. Beddingfield, Kelly Goff, Stephanie Z. Killeen, Nicole R. Chirichella, Alexandra Melton, Chad J. Roy, Nicholas J. Maness
In recent months, several SARS-CoV-2 variants have emerged that enhance transmissibility and escape host humoral immunity. Hence, the tracking of viral evolutionary trajectories is clearly of great importance. Little is known about SARS-CoV-2 evolution in nonhuman primate models used to test vaccines and therapies and to model human disease. Viral RNA was sequenced from rectal swabs from Chlorocebus aethiops (African green monkeys) after experimental respiratory SARS-CoV-2 infection. Two distinct patterns of viral evolution were identified that were shared between all collected samples. First, mutations in the furin cleavage site that were initially present in the virus as a consequence of VeroE6 cell culture adaptation were not detected in viral RNA recovered in rectal swabs, confirming the necessity of this motif for viral infection in vivo. Three amino acid changes were also identified; ORF 1a S2103F, and spike D215G and H655Y, which were detected in rectal swabs from all sampled animals. These findings are demonstrative of intra-host SARS-CoV-2 evolution and may identify a host-adapted variant of SARS-CoV-2 that would be useful in future primate models involving SARS-CoV-2 infection.
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【저자키워드】 Evolution, SARS-CoV-2, African green monkey (Chlorocebus aethiops), 【초록키워드】 viral infection, Vaccine, therapy, Mutation, furin, SARS-COV-2 infection, SARS-CoV-2 variant, virus, RNA, Humoral immunity, Viral, Transmissibility, SARS-CoV-2 variants, viral evolution, furin cleavage site, Cell culture, Rectal swabs, trajectory, SARS-CoV-2 evolution, Viral RNA, respiratory, in vivo, Amino acid, H655Y, green monkeys, human disease, African green monkeys, motif, D215G, Host, rectal swab, ENhance, variant of SARS-CoV-2, amino acid change, identify, collected, sequenced, ORF, in viral, Chlorocebus, 【제목키워드】 African, green, Chlorocebus,
최근 몇 달 동안 전염성을 높이고 숙주의 체액성 면역을 피하는 여러 SARS-CoV-2 변이체가 나타났습니다. 따라서 바이러스 진화 궤적의 추적은 분명히 매우 중요합니다. 백신 및 치료법을 테스트하고 인간 질병을 모델링하는 데 사용되는 비인간 영장류 모델에서 SARS-CoV-2 진화에 대해서는 알려진 바가 거의 없습니다. 바이러스 RNA는 실험적인 호흡기 SARS-CoV-2 감염 후 Chlorocebus aethiops(아프리카 녹색 원숭이)의 직장 면봉에서 시퀀싱되었습니다. 수집된 모든 샘플 간에 공유되는 두 가지 뚜렷한 바이러스 진화 패턴이 확인되었습니다. 첫째, VeroE6 세포 배양 적응의 결과로 바이러스에 처음 존재했던 푸린 절단 부위의 돌연변이는 직장 면봉에서 회수된 바이러스 RNA에서 검출되지 않았으며, 이는 생체내 바이러스 감염에 대한 이 모티프의 필요성을 확인시켜줍니다. 세 가지 아미노산 변화도 확인되었습니다. ORF 1a S2103F 및 스파이크 D215G 및 H655Y는 모든 표본 동물의 직장 면봉에서 검출되었습니다. 이러한 발견은 숙주 내 SARS-CoV-2 진화를 입증하며 SARS-CoV-2 감염과 관련된 미래의 영장류 모델에 유용할 SARS-CoV-2의 숙주 적응 변이체를 식별할 수 있습니다.