Many CRISPR/Cas platforms have been established for the detection of SARS-CoV-2. But the detection platform of the variants of SARS-CoV-2 is scarce because its specificity is very challenging to achieve for those with only one or a few nucleotide(s) differences. Here, we report for the first time that chimeric crRNA could be critical in enhancing the specificity of CRISPR-Cas12a detecting of N501Y, which is shared by Alpha, Beta, Gamma, and Mu variants of SARS-CoV-2 without compromising its sensitivity. This strategy could also be applied to detect other SARS-CoV-2 variants that differ only one or a few nucleotide(s) differences.
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【초록키워드】 SARS-CoV-2, SARS-CoV-2 variant, variants, CRISPR, sensitivity, specificity, SARS-CoV-2 variants, N501Y, Gamma, Alpha, Beta, Critical, platform, nucleotide, chimeric, variants of SARS-CoV-2, detect, 【제목키워드】 specificity, Gamma, N501Y mutation, variants of SARS-CoV-2, IMPROVE,
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SARS-CoV-2의 탐지를 위해 많은 CRISPR/Cas 플랫폼이 구축되었습니다. 그러나 SARS-CoV-2 변이체의 탐지 플랫폼은 희소합니다. 하나 또는 몇 개의 뉴클레오티드 차이가 있는 사람들의 특이성은 달성하기가 매우 어렵기 때문입니다. 여기에서 우리는 키메라 crRNA가 민감도를 손상시키지 않으면서 SARS-CoV-2의 Alpha, Beta, Gamma 및 Mu 변이체가 공유하는 N501Y를 감지하는 CRISPR-Cas12a의 특이성을 향상시키는 데 중요할 수 있음을 처음으로 보고합니다. 이 전략은 하나 또는 몇 개의 뉴클레오티드 차이만 다른 다른 SARS-CoV-2 변이체를 감지하는 데에도 적용될 수 있습니다.