ASPICov was developed to provide a rapid, reliable and complete analysis of NGS SARS-Cov2 samples to the biologist. This broad application tool allows to process samples from either capture or amplicon strategy and Illumina or Ion Torrent technology. To ensure FAIR data analysis, this Nextflow pipeline follows nf-core guidelines and use Singularity containers. Pipeline is implemented and available at https://gitlab.com/vtilloy/aspicov .
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【초록키워드】 NGS, Data analysis, Illumina, Analysis, capture, biologist, Complete, Ion, 【제목키워드】 variant, automated,
【초록키워드】 NGS, Data analysis, Illumina, Analysis, capture, biologist, Complete, Ion, 【제목키워드】 variant, automated,
ASPICov는 생물학자에게 NGS SARS-Cov2 샘플의 신속하고 신뢰할 수 있으며 완전한 분석을 제공하기 위해 개발되었습니다. 이 광범위한 응용 도구를 사용하면 캡처 또는 앰플리콘 전략과 Illumina 또는 Ion Torrent 기술의 샘플을 처리할 수 있습니다. FAIR 데이터 분석을 보장하기 위해 이 Nextflow 파이프라인은 nf-core 지침을 따르고 Singularity 컨테이너를 사용합니다. 파이프라인은 https://gitlab.com/vtilloy/aspicov 에서 구현 및 사용할 수 있습니다.