[저자] Catherine A. Hogan, Agatha N. Jassem, Hind Sbihi, Yayuk Joffres, John R. Tyson, Kyle Noftall, Marsha Taylor, Tracy Lee, Chris Fjell, Amanda Wilmer, John Galbraith, Marc G. Romney, Bonnie Henry, Mel Krajden, Eleni Galanis, Natalie Prystajecky, Linda M.N. Hoang
Several severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 variants of concern (VOCs) emerged in late 2020; lineage B.1.1.7 initially dominated globally. However, lineages B.1.351 and P.1 represent potentially greater risk for transmission and immune escape. In British Columbia, Canada, B.1.1.7 and B.1.351 were first identified in December 2020 and P.1 in February 2021. We combined quantitative PCR and whole-genome sequencing to assess relative contribution of VOCs in nearly 67,000 infections during the first 16 weeks of 2021 in British Columbia. B.1.1.7 accounted for <10% of screened or sequenced specimens early on, increasing to >50% by week 8. P.1 accounted for <10% until week 10, increased rapidly to peak at week 12, and by week 13 codominated within 10% of rates of B.1.1.7. B.1.351 was a minority throughout. This rapid expansion of P.1 but suppression of B.1.351 expands our understanding of population-level VOC patterns and might provide clues to fitness determinants for emerging VOCs.
All Keywords
【저자키워드】 COVID-19, coronavirus disease, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, viruses, respiratory infections, zoonoses, public health, SARS-CoV-2, Testing, variant of concern, Canada, British Columbia, Suggested citation for this article: Hogan CA, Jassem AN, Sbihi H, Joffres Y, Tyson JR, Noftall K, et al. Rapid increase in SARS-CoV-2 P.1 lineage leading to codominance with B.1.1.7 lineage, 【초록키워드】 whole-genome sequencing, coronavirus, VoC, B.1.351, Infection, variants of concern, risk, Transmission, Immune escape, B.1.1.7, P.1, VOCs, Lineage, Lineage B.1.1.7, respiratory, Canada, quantitative PCR, determinant, acute respiratory syndrome, acute respiratory syndrome coronavirus, suppression, specimen, rapid expansion, greater, sequenced, screened, accounted, expand, 【제목키워드】 P.1, Rapid, leading, increase, Codominance,
여러 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2 우려 변종(VOC)이 2020년 말에 나타났습니다. 계보 B.1.1.7은 처음에 전 세계적으로 지배되었습니다. 그러나 계통 B.1.351 및 P.1은 잠재적으로 전파 및 면역 탈출의 더 큰 위험을 나타냅니다. 캐나다 브리티시 컬럼비아에서 B.1.1.7 및 B.1.351이 2020년 12월에 처음 확인되었고 P.1은 2021년 2월에 확인되었습니다. 우리는 정량적 PCR과 전체 게놈 시퀀싱을 결합하여 기간 동안 거의 67,000건의 감염에서 VOC의 상대적 기여도를 평가했습니다. 브리티시 컬럼비아에서 2021년의 첫 16주. B.1.1.7은 초기에 선별 또는 시퀀싱된 표본의 <10%를 차지했으며 8주차에는 >50%로 증가했습니다. 13 B.1.1.7의 비율의 10% 이내에서 공동 지배. B.1.351은 전체적으로 소수였습니다. P.1의 급속한 확장과 B.1.351의 억제는 인구 수준의 VOC 패턴에 대한 이해를 확장하고 새로운 VOC에 대한 적합성 결정 요인에 대한 단서를 제공할 수 있습니다.