[저자] Manci Li, Luca Schifanella, Peter A. Larsen
SARS-CoV-2 has spread rapidly across the world and is negatively impacting the global human population. COVID-19 patients display a wide variety of symptoms and clinical outcomes, including those attributed to genetic ancestry. Alu retrotransposons have played an important role in human evolution, and their variants influence host response to viral infection. Intronic Alu s regulate gene expression through several mechanisms, including both genetic and epigenetic pathways. With respect to SARS-CoV-2, an intronic Alu within the ACE gene is hypothesized to be associated with COVID-19 susceptibility and morbidity. Here, we review specific Alu polymorphisms that are of particular interest when considering host response to SARS-CoV-2 infection, especially polymorphic Alu insertions in genes associated with immune response and coagulation/fibrinolysis cascade. We posit that additional research focused on Alu -related pathways could yield novel biomarkers capable of predicting clinical outcomes as well as patient-specific treatment strategies for COVID-19 and related infectious diseases. Supplementary Information The online version contains supplementary material available at 10.1186/s40246-020-00299-9.
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【저자키워드】 COVID-19, SARS-CoV-2, ACE, PGR, PLAT, F13B, Human evolution, 【초록키워드】 Evolution, viral infection, immune response, Biomarker, Infectious diseases, Diseases, Gene Expression, SARS-COV-2 infection, susceptibility, Genetic, variant, polymorphism, Symptom, host response, clinical outcomes, Clinical outcome, Spread, Viral, morbidity, Research, pathway, mechanisms, Alu, Epigenetic, COVID-19 patients, COVID-19 susceptibility, regulate, Pathways, treatment strategy, COVID-19 patient, human population, supplementary material, insertion, cascade, retrotransposon, ACE gene, Intronic, variety, with COVID-19, 【제목키워드】 Alu, retrotransposon,
SARS-CoV-2는 전 세계적으로 빠르게 확산되어 전 세계 인구에 부정적인 영향을 미치고 있습니다. COVID-19 환자는 유전적 조상에 기인한 것을 포함하여 다양한 증상과 임상 결과를 나타냅니다. Alu 레트로트랜스포존은 인간 진화에서 중요한 역할을 했으며, 그 변이체는 바이러스 감염에 대한 숙주 반응에 영향을 미칩니다. Intronic Alu는 유전 및 후성 유전 경로를 포함한 여러 메커니즘을 통해 유전자 발현을 조절합니다. SARS-CoV-2와 관련하여 ACE 유전자 내의 인트론 Alu는 COVID-19 감수성 및 이환율과 관련이 있는 것으로 가정됩니다. 여기에서 우리는 SARS-CoV-2 감염에 대한 숙주 반응, 특히 면역 반응 및 응고/섬유소 용해 캐스케이드와 관련된 유전자의 다형성 Alu 삽입을 고려할 때 특히 관심이 있는 특정 Alu 다형성을 검토합니다. 우리는 Alu 관련 경로에 초점을 맞춘 추가 연구가 COVID-19 및 관련 전염병에 대한 환자별 치료 전략뿐만 아니라 임상 결과를 예측할 수 있는 새로운 바이오마커를 산출할 수 있다고 가정합니다. 보충 정보 온라인 버전에는 10.1186/s40246-020-00299-9에서 사용할 수 있는 보충 자료가 포함되어 있습니다.